El ensamblaje del genoma del mejillón azul (Mytilus edulis), pariente cercano de nuestro mejillón mediterráneo (Mytilus galloprovincialis), representa un importante avance para mejorar la acuicultura de estos moluscos bivalvos de gran importancia comercial.
Este ensamblaje ha sido logrado por investigadores del Instituto Roslin y la Escuela Real (Dick) de Estudios Veterinarios de la Universidad de Edimburgo, en colaboración con Atlantic Aqua Farms Ltd., y representa un avance significativo en la genética de esta especie, proporcionando una herramienta fundamental para mejorar la acuicultura, la ecología marina y los estudios evolutivos.
En lo relativo a la acuicultura, las aplicaciones pasan por la mejora genética en programas de cría, la identificación de marcadores genéticos, el monitoreo y control de la hibridación, el diagnóstico y manejo de enfermedades, la optimización de condiciones de cultivo, los estudios de ecotoxicología y biorremediación, y la conservación y gestión de recursos naturales.
El estudio, cuyos resultados han sido publicados en la revista científica G3: Genes, Genomes, Genetics, muestra que para lograr el ensamblaje del genoma a escala cromosómica se utilizó una combinación de secuenciación PacBio y la tecnología Omni-C de Dovetail. El resultado fue un ensamblaje con 14 andamios largos que representan el 94% del genoma predicho de Mytilus edulis, con una longitud total de 1,65 Gb y un N50 de 116 Mb. Este ensamblaje de alta calidad incluye la predicción de 47.128 genes, de los cuales 45.379 corresponden a secuencias completas de proteínas CDS y 129.708 a isoformas.
Posibles aplicaciones en acuicultura
Como se ha mencionado, el ensamblaje del genoma de esta especie proporciona una base genética sólida que se puede utilizar en programas de cría más eficientes. Esto permite la selección de mejillones con características deseables, como mayor resistencia a enfermedades, mejor crecimiento y mayor adaptabilidad a diferentes condiciones ambientales.
Además, la posibilidad de identificar marcadores genéticos SNP y otras variaciones genéticas, son útiles para monitorear y gestionar poblaciones de acuicultura, asegurando la sostenibilidad y salud genética de los cultivos. La información que se puede obtener de estos marcadores facilita el desarrollo de estrategias para el diagnóstico precoz y el manejo efectivo de patógenos.
Este avance también permite monitorizar y controlar la hibridación con otras especies del complejo Mytilus spp, lo cual es importante para evitar la introducción de genes no deseados que puedan afectar negativamente la viabilidad de los mejillones cultivados.
En un plano más ambientalista, los mejillones son conocidos por su capacidad de filtrar y acumular contaminantes del medio. El estudio del genoma puede proporcionar información importante para comprender mejor cómo los mejillones responden a estos contaminantes y para desarrollar estrategias de biorremediación.
Referencia:
Tim Regan, Tiago S Hori, Tim P Bean. A chromosome-scale Mytilus edulis genome assembly for aquaculture, marine ecology, and evolution. G3 Genes|Genomes|Genetics
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