Investigadores del Institute of Hydrobiology de la Chinese Academy of Sciences y del Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (China) han publicado los primeros genomas de alta calidad y a nivel cromosómico de machos y hembras de seriola (Seriola dumerili), una especie de gran interés comercial para la acuicultura marina por su rápido crecimiento y la alta calidad de su carne.
Aunque este logro supone un avance científico relevante, también tiene implicaciones claras para el sector acuícola. La disponibilidad de genomas cromosómicos diferenciados por sexo constituye un recurso estratégico que puede apoyar futuros desarrollos en mejora genética, control reproductivo y gestión de reproductores.
En concreto, este primer genoma cromosómico puede ayudar a los productores de seriola a reforzar los programas de selección genética, impulsar el desarrollo de herramientas moleculares para la identificación temprana del sexo y avanzar en la investigación sobre reproducción, crecimiento y rendimiento de los reproductores en condiciones de cultivo.
Desde un punto de vista práctico, las empresas de acuicultura podrían aplicar esta información mediante proyectos de I+D y colaboraciones con centros de investigación, utilizando los datos genómicos como base para desarrollar herramientas de sexado, mejorar las estrategias de selección y optimizar la gestión de reproductores a medio y largo plazo.
El estudio, publicado en Scientific Data, aborda una limitación histórica de los recursos genómicos disponibles para la seriola. Como señalan los autores, «la disponibilidad actual de datos genómicos, que es incompleta y discontinua, limita los estudios de biología molecular en la seriola».
Para superar esta carencia, los investigadores emplearon una combinación de secuenciación de lectura larga PacBio HiFi, lecturas cortas DNBSEQ y datos Hi-C, con los que ensamblaron genomas de 637 Mb en machos y 639,4 Mb en hembras, ambos organizados en 24 cromosomas. La calidad del genoma se evaluó mediante BUSCO, alcanzando una completitud del 98,5 % en machos y del 98,71 % en hembras, lo que indica ensamblajes de muy alta calidad.
Según los autores, la calidad de estos genomas es comparable a la del ensamblaje cromosómico más reciente disponible hasta la fecha para la especie, que estaba basado únicamente en un solo sexo.
Uno de los principales motivos para desarrollar genomas específicos por sexo responde a un problema práctico para los productores: los machos y las hembras de seriola no pueden distinguirse de forma fiable por su morfología externa, ni siquiera durante la época de puesta. Esta ausencia de dimorfismo sexual visible dificulta la selección de reproductores y la planificación reproductiva en las explotaciones acuícolas.
En este contexto, el estudio subraya que «la construcción de genomas de alta calidad de machos y hembras de seriola sentará las bases para dilucidar el mecanismo de diferenciación sexual de la especie».
Los análisis comparativos de genoma completo mostraron un alto grado de conservación estructural entre los genomas de machos y hembras, sin evidencias de grandes reordenamientos cromosómicos ni de cromosomas sexuales heteromórficos.
Además, los investigadores identificaron y anotaron funcionalmente 24.112 genes codificantes de proteínas en el genoma masculino y 23.571 en el femenino, con cerca del 90 % de los genes asociados a funciones biológicas conocidas a través de bases de datos públicas como GO, KEGG, Swiss-Prot y eggNOG.
Según los autores, la disponibilidad de estos genomas de alta calidad y diferenciados por sexo proporciona una base sólida para futuros trabajos en mejora genética molecular, biología reproductiva, conservación de la especie e investigación evolutiva. El estudio concluye que los nuevos ensamblajes «aportan información valiosa para la mejora genética molecular, la conservación de la especie y la investigación evolutiva de la seriola».
Todos los datos de secuenciación y los ensamblajes genómicos generados en el estudio se han depositado en repositorios públicos, como NCBI y el Genome Warehouse, lo que garantiza el acceso abierto para la comunidad científica y el sector acuícola.
Te puede interesar
Agenda
-
19novmié, 19 nov - jue, 20 novCampus del Carmen, Universidad de Huelva - Huelva
Último reportaje
-
La acuicultura de España pone rumbo a un mar de oportunidades en 2030
La acuicultura española se ha consolidado en las últimas décadas como un pilar estratégico para la producción de alimentos sostenibles… España es hoy el primer productor acuícola de la Unión Europea