Investigadores españoles muestran como se organiza el ADN del rodaballo para conseguir su forma aplanada

Científicos del Laboratorio de Biotecnología Acuática (AcuaBioTec Lab) del Instituto de Investigaciones Marinas de Vigo (IIM-CSIC), en colaboración con el Pescanova Biomarine Center, ha creado por primera vez, mediante la aplicación de técnicas genómicas de última generación, un mapa interactivo que muestra cómo se organiza y empaqueta el AND del rodaballo para darle su forma aplanada tan característica.

El estudio ha estado liderado por el investigador Josep Rotllant, y del grupo de Juan Tena del Centro Andaluz de Biología del Desarrollo (CABD-CSIC).

Aunque la metamorfosis es un proceso postembrionario ampliamente estudiado, como comenta la investigadora postdoctoral Laura Guerrero del grupo de Biotecnología Acuática, se desconocían “las bases genéticas de este increíble proceso de transformación corporal”.

Se trata, como señalan, de una “herramienta útil y fiable” para avanzar en el estudio molecular de la metamorfosis del rodaballo. En esta herramienta, como explica, se incluyeron cuatro etapas: la filotípica (3 días posteriores a la fecundación), premetamórfica (15 días posteriores a la eclosión) y clímax de metamorfosis (23 días) y post-metamórfica (37 días).

Le metodología para llevar a cabo el diseño y la puesta a punto de la herramienta incluyó tanto la selección de muestras, lo que abarcó las cuatro etapas de desarrollo citadas anteriormente, como la extracción y secuenciación de ADN y ARN y los diferentes análisis ómicos (ATACseq y RNAseq), entre otras.

Juan Tena, del Centro Andaluz de Biología del CSIC, comenta que “ha sido una experiencia estupenda poder contribuir para este trabajo con apoyo técnico para la realización de algunos análisis”.

Esta nueva herramienta, señalan los investigadores, permitirá a la comunidad científica estudiar en profundidad las bases moleculares de este proceso, pudiendo bucear directamente por un mapa interactivo del ADN que desvela zonas activas e inactivas del genoma durante la metamorfosis de este animal, y que por tanto ayudará a comprender la cuestión fundamental de cómo un único genoma “puede crear dos diseños corporales completamente diferentes en un mismo animal”.

El trabajo se ha llevado a cabo en el marco del proyecto: “One genome for two body plans: genome-wide functional genomic and transcriptomic approaches to understand the genetic bases of fish metamorphosis”, correspondiente al Programa Estatal de Fomento de la Investigación Científica y Técnica de Excelencia (Subprograma Estatal de Generación del Conocimiento), en el marco del Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013- 2016.

Referencia

Guerrero-Peña L, Suarez-Bregua P, Gil-Gálvez A, Naranjo S, Méndez-Martínez L, Tur R, García-Fernández P, Tena JJ, Rotllant J.Genome-wide chromatin accessibility and gene expression profiling during flatfish metamorphosis. Scientific Data. 2023 8;10(1):196. doi: 10.1038/s41597-023-02111-4