Las bacterias transitorias tienen la clave para el uso de los probióticos en la dorada

Un estudio del Instituto de Acuicultura Torre de la Sal (IATS, CSIC) en la dorada (Sparus aurata) cuestiona la falta de estandarización en la investigación del microbioma de los peces cultivados. Los resultados, publicados en la revista científica Animals, demuestran que coexisten dos comunidades bacterianas marcadamente distintas: las residentes, adheridas al mucus, y las transitorias, en tránsito con la digesta. Ambas forman comunidades separadas, pero pueden cooperar a nivel funcional.

El trabajo tiene implicaciones directas para el desarrollo de probióticos en la industria de la acuicultura. El estudio evidencia que algunas de estas bacterias pueden ejercer efectos positivos en el huésped formando parte de la comunidad transitoria, sin necesidad de colonizar de forma permanente el mucus intestinal.

Tradicionalmente, en los estudios de microbioma en peces no ha existido un consenso claro sobre qué comunidad analizar, abordándose muchas veces de forma conjunta o bajo criterios arbitrarios. Sin embargo, la investigación revela que el tipo de comunidad bacteriana (autóctona frente a alóctona) es el principal factor que moldea la composición del microbioma de la dorada, superando los efectos de la región intestinal muestreada o el tiempo transcurrido desde la última ingesta.

Cada comunidad mostró una clara especialización en vías fisiológicas específicas y complementarias. Las bacterias residentes se asocian principalmente a las vías del metabolismo de las proteínas, así como a su digestión y absorción. Por su parte, los microorganismos transitorios contribuyen fundamentalmente al metabolismo de carbohidratos y a la síntesis de ácidos biliares.

En conjunto, los autores subrayan la importancia de elegir y definir de forma explícita qué fracción microbiana evaluar según los procesos funcionales y la pregunta biológica de interés, marcando una guía metodológica clara para futuros estudios de microbioma en peces.

Referencia:

Belenguer, A., Moroni, F., Naya-Català, F., Holhorea, P. G., Domingo-Bretón, R., Calduch-Giner, J. A., & Pérez-Sánchez, J. (2026). Autochthonous and Allochthonous Gut Microbes May Work Together: Functional Insights from Farmed Gilthead Sea Bream (Sparus aurata). Animals, 16, 360 . https://doi.org/10.3390/ani16030360