La publicación del genoma de la lubina europea permitirá avanzar más rápido en los planes de mejora

Europa 24/11/2014 - Investigadores europeos han secuenciado el genoma completo de la lubina (Dicentrarchus labrax) y aportan ideas de las variaciones proporcionadas por la adaptación eurihalina y especiación.

Como principales autores destacan Richard Reinhardt, del Centro Max Planck Genome de Colonia, en Alemania; Adelino Canario, del Centro de Ciencias del Mar en la Universidad del Algarve, en Portugal; y Fançois Bonhomme, de la Estación Mediterránea del Medioambiente Litoral, de la Universidad de Montpellier, en Francia.

El ensamble del genoma, según indican los investigadores, representa “uno de los mayores proyectos de alta calidad disponibles para una especie de importancia en acuicultura, y proporciona un valioso recurso para los análisis evolutivos futuros para la mejora genética de la especie, pudiendo facilitar los estudios genómicos de otros peces teleósteos de importancia económica acuícola”.

Además, añaden, el genoma de la lubina ofrece un modelo interesante para la comprensión de los mecanismos evolutivos implicados en la especiación. “Nuestros resultados implican barreras reproductivas de base genética que reduce el flujo de genes entre los linajes de lubina del Atlántico y del Mediterráneo”.

Según indican, la especie se subdivide en dos líneas de hibridación natural. Una en el noroeste del Océano Atlántico y la otra en el Mediterráneo y el mar Negro. El documento describe un conjunto de cromosomas de alta calidad de su genoma que muestra un alto grado de sintenia con los teleósteos altamente derivados.

También destacan las expresiones de las familias de genes específicamente asociados con iones y la regulación del agua, destacando la adaptación a la variación de salinidad.

Han generado además un mapa de la variación en todo el genoma a través de la secuenciación RAD – del Atlántico y las poblaciones mediterráneas. Se demuestra que la variación en las tasas de recombinación locales influye fuertemente en el paisaje genómico de la diversidad dentro y diferenciación entre linajes.

La publicación del genoma de la lubina abre un mundo de aplicaciones en el campo de la mejora genética. En el caso de la acuicultura permitirá a los investigadores ahorrar tiempo en los planes de mejora y predecir a priori los resultados esperados. Tanto el rendimiento, el crecimiento o la resistencia a enfermedades, son algunas de las aplicaciones que se pueden obtener con este conocimiento.

Cabe recordar que el pasado mes de octubre, la investigadora del Nofima, Anna Sorensen criticó y calificó como “increíble” que no se hubiera publicado aún el genoma de referencia para la dorada y la lubina. Una vez descifrado el genoma de la lubina falta esperar que se publique el de otras especies de interés en la acuicultura mediterránea como el de la dorada o el lenguado.