Investigadores desarrollan un sistema de análisis de pigmentación en peces

Tarragona 14/07/2016 – Investigadores israelitas de la School of Marine Sciences de la Ruppin Academic Center en Israel y españoles del IRTA San Carlos de la Rápita acaban de publicar en la revista Aquaculture un sistema basado en dos archivos de procesamiento por lotes (scripts, en inglés) en lenguaje Phyton y R que permite analizar el patrón de pigmentación de la piel en peces mediante técnicas de análisis de la imagen.

El artículo en cuestión lleva por título “Image analysis-based classification of pigmentation patterns in fish: A case study of pseudo-albinism in Senegalese sole”. Para ello, los autores del trabajo han analizado cuatro parámetros (homogeneidad, contraste, energía y correlación) relacionados con la “textura” de cualquier objeto o imagen.

Según declara Asher Wishkerman profesor de la School of Marine Sciences, dichos parámetros están basados en los valores del brillo de la imagen en escala de grises y su relación con los píxeles adyacentes dentro de la zona objeto de interés.

En nuestro caso particular, los distintos cromatóforos de la piel y su patrón de distribución a lo largo de la piel nos permitirían caracterizar de forma objetiva y estandarizada la pigmentación de la piel, tal y como se ha comprobado con ejemplares post-metamórficos de lenguado que fueron inducidos nutricionalmente (exceso de ácido araquidónico en la dieta) a presentar problemas de pseudo-albinosis.

Para ello sólo es necesario una buena fotografía de la piel de los animales objeto de estudio, fotografía que puede ser tomada directamente o a través de una lupa binocular en el caso de animales pequeños, una computadora donde dichas imágenes en color sean convertidas en escala de grises y puedan ser analizadas con los scripts presentados tanto en un entorno Linux, Windows o Mac OS X.

Según explicó al respecto Enric Gisbert del IRTA, el citado archivo ha sido publicado en código abierto lo que permitirá que esta herramienta pueda ser usada por investigadores relacionados con el ámbito de la acuicultura que deseen evaluar la calidad pigmentaria de sus peces. Esta aplicación, añade, es “de gran interés para peces planos donde los problemas de malpigmentación y pseudo-albinosis son comunes”.

Igualmente, indica el experto, podrá ser empleada en “aquellos trabajos relacionados con la biología y ecología de las especies silvestres (patrones de pigmentación de la piel asociados al cortejo, estrés y/o cambios de éstos en función de las condiciones ambientales).

Otra potencial aplicación de dicha herramienta, indica Enric Gisbert estaría en “la evaluación de la calidad de los peces en acuicultura mediante el desarrollo de una herramienta de análisis de imagen automatizada y en tiempo real que permitiera la discriminación de los animales correctamente pigmentados de los que presentan alguna anomalía y su separación durante algunas de las fases del procesado de los peces tras su cultivo”.
Cabe destacar que este trabajo fue financiado por el proyecto AGL2008-03897-C04-01/ACU gracias al Ministerio de Ciencia e Innovación (MICIIN) del Gobierno de España.

Referencia bibliográfica:
Image analysis-based classification of pigmentation patterns in fish: A case study of pseudo-albinism in Senegalese sole

Asher Wishkermana, Anaïs Boglinob, Maria Jose Dariasc, Karl B. Andreed, Alicia Estévezd, Enric Gisbertd