Investigadores españoles y escoceses publican primeros datos sobre transcriptoma de músculo de dorada

San Carlos de la Rápita (Tarragona) 21/05/2012 – Investigadores de la Universidad de St Andrews en Escocia y del IRTA en San Carlos de la Rápita en España han publicado en la revista BMC Genomics los primeros datos relativos del transcriptoma del músculo de dorada (Sparus aurata).

Según la información enviada a misPeces desde el IRTA, la investigación se enmarca en el proyecto europeo LifeCycle del Séptimo Programa Marco y lleva por objetivo el desarrollo de herramientas para la resolución de distintos "cuellos de botella" relacionados con la industria acuícola.

Para los investigadores Daniel García de la Serrana e Ian Johnston del Physiology and Evolutionary Genomics Laboratory de la Universidad de St Andrews y responsables del trabajo, la publicación del transcriptoma de músculo de dorada representa "un notable incremento de la información genética sobre la citada especie; y en particular, sobre su tejido muscular, pues se han podido identificar numerosos factores de transcripción, moléculas de señalización y proteínas estructurales necesarias para la miogénesis y crecimiento del músculo".

De este modo, añaden, la secuenciación y anotación de varios miles de genes "ayudará a entender mejor la biología de esta especie y en particular la fisiología del tejido muscular esquelético".

Asimismo, la comparación del transcriptoma del músculo en animales adultos (2 kg) y juveniles (90 g) bajo distintas condiciones nutricionales ha permitido detectar que el estado fisiológico del animal afecta directamente el número de copias de distintas secuencias génicas, reflejando cambios en la expresión génica de dichos marcadores entre los grupos estudiados.

La información generada no sólo es interesante desde un punto de vista de generación de conocimiento básico, sino también desde un punto de vista aplicado.

Así, el análisis del transcriptoma ha permitido identificar grupos de microsatélites (secuencias variables de DNA) que permitirán la selección de especímenes para lo mejora genética.

Además, el gran número de secuencias obtenidas facilitará los estudios para establecer relaciones entre variables genéticas y caracteres de interés comercial (mayor crecimiento, mejor textura de la carne, menor grasa intramuscular) y así, junto con los microsatélites, poder implementar programas de mejora genética de la dorada de cultivo con vistas a mejorar el producto final.