Larvas de ostra planta (Ostrea edulis)
Dos equipos de investigadores, uno en del Roslin Institute Reino Unido y otro francés de la Universidad de la Sorbona han decidido colaborar y no competir en la coedición del genoma de la ostra plana europea (Ostrea edulis) y ensamblar sus propias versiones.
Este trabajo acontece como el resultado del descubrimiento fortuito de que los dos grupos de investigación estaban inmersos en el proceso de construcción, anotación e investigación de ensamblajes producidos por separado.
Como señalan en un artículo publicado en Evolutionary Applications, debido a las limitaciones de financiación y la necesidad que los investigadores que están iniciando su carrera y se reconozca su trabajo, junto con el desafío técnico de integrar ensamblajes de dos genomas muy diferentes, no se dio la posibilidad de fusionar ambas secuencias en un solo artículo.
Es probable, como señalan, que este problema se vuelva muy común en los próximos años hasta que las tecnologías para trabajar con múltiples genomas a la vez. Por ejemplo, graficar genomas, se vuelvan comunes en especies que no son modelo.
El estudio de ambos genomas está siendo utilizados ampliamente por los investigadores de ostra plana en Europa, en la búsqueda de variaciones y rasgos de crecimiento para la mejora selectiva.
Ahora, con el ensamblaje de ambos genomas de referencia se busca mejorar los esfuerzos de conservación en curso y los programas de cría selectiva, mejorando a su vez la comprensión de la evolución del genoma de los bivalvos.
Además de la mejora en los programas de reproducción para mejorar el rendimiento productivo en acuicultura a través de los mejores candidatos, el estudio del genoma ayudará a la restauración de esta especie en el medio y conseguir una mayor resiliencia de las ostras al parásito Bonamia ostreae.
Referencia:
Bean, T. P., Tanguy, A., Peñaloza, C., Gundappa, M. K., Boutet, I., Houston, R. D., Macqueen, D. J., & Boudry, P. (2022). Two parallel chromosome-level reference genomes to support restoration and aquaculture of European flat oyster Ostrea edulis. Evolutionary Applications, 00, 1–4.
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